Во вкладке Virtualmin выбираем +Bakup/Restore -> Scheduled backup и заполняем следующие поля:

+ Virtual servers
Servers to save: отмечаем опцию All virtual servers либо Only selected если хотим резервировать домены выборочно.

+ Features and settings
Features to backup : отмечаем опцию Backup all features.

+ Destination and format
Backup destination:  выбираем опцию  FTP server и заполняем:
FTP server: ftp1.amhost.net (FTP cервер куда собираемся производить резервное копирование);
File on server: /backup/ (Каталог на FTP куда будет залит бекап);
Login as user: user (логин для FTP cервера);
with password: (пароль для FTP cервера).

+ Schedule and reporting
Email backup report to: user@domain.com (указываем почтовый ящик на который отправлять сообщение об ошибке возникшей при резервном копировании. Отмечаем соответственно опцию Only send email on failure.
Scheduled backup time отмечаем опцию Complex shedule, нажимаем на кнопку "троеточие" и в открывшемся окне выставляем время резервного копирования как показано на изображении, в данном примере резервное копирование производится в 3.00 каждый понедельник.
Нажимаем OK. И затем нажимаем Create Shedule.

Выбираем Baсkup/Restore -> Backup Virtual Servers и нажимаем Backup Now для начала резервного копирования и  проверки сделанных нами настроек.